Том. I. Аскетические опыты. Часть I. Дополнение — Слово о человеке. Приложение — Воспоминания М. В. Чихачова и Александры Купреяновой.
Том. II. Аскетические опыты. Часть II. Дополнение Архипастырские воззвания по вопросу освобождения крестьян от крепостной зависимости (1859). Комментарии А. М. Любомудрова. Приложение — Из консисторской переписки Святителя.
Том. III. Слово о смерти. Дополнение — Археологическое описание древностей Валаамского монастыря (1853). Приложение - Консисторская переписка (продолжение).
Том. IV. Аскетическая проповедь. Дополнение - Неизданные произведения Святителя (проза и стихи). Приложение - Библиография публикаций творений святителя Игнатия Брянчанинова и литературы о нем (сост. Т. Н. Семенова).
Том. V. Приношение современному монашеству. Дополнение - Письма святителя Игнатия игумену Череменецкого монастыря игумену Антонию (Алексею Панкратьевичу Бочкову). Приложение - Письма к Владыке: митрополита Московского Филарета (Дроздова), митрополита Киевского Филарета (Амфитеатрова), архимандрита Игнатия (Малышева), архимандрита Пимена (Мясникова); Оптинских старцев: Моисея, Леонида, Макария, Анатолия и др.; Площанских старцев: Анатолия, Илария, Иоанникия и др.
Том. VI. Отечник. Дополнение письма епископа Игнатия к мирянам: Н. Н. Муравьеву-Карскому, А. С. Норову, кн. Д. Н. Шереметеву, А. С. Танееву, обер-прокурору Святейшего Синода А. П. Толстому и др. Приложение - письма светских лиц к святителю Игнатию.
Тома. VII-VIII. Письма. Заключительные тома Собрания творений Святителя посвящены публикации его многочисленных писем разным лицам, многие тексты выверены по рукописям или публикуются впервые. Приложение Отклики печати на выход в свет творений святителя Игнатия. Богословские рассмотрения его писаний. Материалы к канонизации великого подвижника Божия.