Любой практически PDf и DJVU графический формат (кроме дореформенного и церковно-славянского шрифта) можно с легкостью перевести в любой существующий формат через программку ABBYY FineReader 11 Professional Edition (скачать можно где-то здесь :
http://rutor.org/search/ABBYY+FineReader)
Можно там также делать с PDf и DJVU документами многие вещи,например обрезать края чтобы при просмотре на электронной книге было нормальное увеличение,или компоновать все в кучу или по отдельности сканы,выравнивать неровности,добавлять пиксели и качество или уменьшать и тд.
Переформатировать можно например в fb2 через ту программу вашу книгу,там есть множество настроек вариантов отображения.
--------------------------------------------------------------------
Далее отредактировать получившийся fb2 если заметили ошибки в изначальном тексте можно с легкостью через программу FictionBook Editor.
Есть еще неплохой конвертер:pdf-doc-fb2
Я им много doc форматов переделал на fb2,поскольку моя электронная книга неадекватно читает doc и он мне неприемлем.
Спаси Господи!